Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms