Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH1P12830 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH1P12830 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms