Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLBP1P12271 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RLBP1P12271 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLBP1P12271 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms