Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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