Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLK3P07288 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms