Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms