Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGF1P05230 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGF1P05230 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGF1P05230 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms