Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX4O95219 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX4O95219 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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