Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms