Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms