Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms