Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD6O43541 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms