Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRODHO43272 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRODHO43272 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms