Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNPHO15079 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms