Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2SURPO15042 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms