Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms