Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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