Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms