Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms