Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms