Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms