Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPR55Q9Y2T6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR55Q9Y2T6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms