Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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