Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms