Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms