Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms