Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms