Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms