Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms