Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms