Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms