Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms