Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms