Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms