Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms