Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms