Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms