Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00597Q9H2U6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms