Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms