Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKD2Q9BZL6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKD2Q9BZL6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms