Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms