Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC8Q9BY41 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms