Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms