Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3CQ9BUI4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms