Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms