Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms