Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms