Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms