Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms