Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms